光速未満の速度で恒星間空間を航行する輸送システムであり、特殊相対性理論のローレンツ因子 γ=1/√(1-v²/c²) に従い、光速に近づくにつれて時間遅延効果が顕著になる。亜光速星間輸送船は反物質エンジンまたは核融合パルス推進を主推進力として採用し、長期間の連続加速と減速により目的地恒星系に到達する。船内時間は地球時間に比べて大幅に短縮されるため、乗員は相対論的効果による時間遅延の恩恵を受けるが、出発時の地球との通信には片道の航行年数に等しい時間的遅れが生じる。E16文明圏では曲率航法やホライゾン・ゲートが利用できない遠距離の恒星間航行において亜光速輸送が補完的な役割を果たしており、人工冬眠システムと組み合わせた数十年規模の長期航行が実施されている。